Nintendo hat den konkreten Europa-Termin für Metroid Prime: Federation Force bekannt gegeben. Demnach erscheint der Titel am 2. September 2016 in Europa für Nintendo 3DS. In dem Multiplayer-Shooter muss man mit bis zu vier Spielern sowohl lokal als auch online verschiedene Missionen bewältigen.
„Wir wollten die Geschichte des Kampfes zwischen der Intergalaktischen Föderation und den Weltraumpiraten erzählen“, so Producer Kensuke Tanabe im März. „Ich hatte mir schon immer Kämpfe zwischen diesen beiden Lagern im Universum ausgemalt. In den vorherigen Spielen haben wir diese Möglichkeit nie wirklich in Erwägung gezogen, aber ich wollte das seit über zehn Jahren machen und habe förmlich darauf gebrannt, es auszuprobieren.“
Samus Aran konnte wegen der Umstände aber kein Hauptcharakter sein.